Um ein authentisches, experimentelles Erlebnis zu bieten, verfügt der Mutation Phasor II über alle Original-Bedienelemente. Für besonders satte, wirbelnde Phasenverschiebungen ermöglicht der „Depth“-Regler die Variation der Breite des Sweep-Bereichs – und liefert so die tiefe Modulation, die man von einem Vintage-Pedal erwartet. Durch Erhöhen des „Depth“-Reglers wird der Frequenzbereich des Effekts erweitert, wodurch höhere Höhen und tiefere Bässe verstärkt werden. Die Geschwindigkeit (oder Rate) des Phasenverschiebungseffekts lässt sich einfach anpassen, um mehr oder weniger „Wobble“ im Ton zu erzeugen – von 1/10 Sweeps pro Sekunde (langsamste Einstellung) bis 18 Sweeps pro Sekunde (schnellste Einstellung). Durch Erhöhen des „Feedback“-Reglers wird dem „Wet“-Phasenverschiebungssignal eine elektrische Rückkopplung hinzugefügt. Eine Erhöhung der Feedback-Kontrolle erzeugt einen intensiveren Phasenklang mit besonderer Betonung der Sweeps, was besonders bei langsameren Einstellungen auffällt.